ANTECEDENTES: 

Durante el reinado de ALFONSO VI DE LEÓN, San Clemente pasó al "Canastillo de Bodas" de la reina mora ZAIDA cuando el Caballero santiaguista CLEMENTE PÉREZ DE RUS Y CASTILLO (fallece en 1136) se encuentra repoblando la aldea sanclementina desde 1098 al reconquistar la Torrevieja a los musulmanes. Por tanto, perteneció a la reina Zaida algo menos de 9 años, y tras su fallecimiento, alrededor de 1107, retornó a la Corona de Castilla como tierras de realengo: luego, San Clemente formaba parte del Señorío de Alarcón, al ser reconquistado su Castillo en 1184; también, al Señorío de Villena con Manuel de Castilla; y al primer Marquesado de Villena de 1366-1385 (19 años), pasando de nuevo a la Corona de Castilla como tierras de realengo durante los reinados de Juan I de Castilla, Enrique III de Castilla y Juan II de Castilla (total 60 años).

Reina mora ZAIDA.

Villa de Señorío con JUAN PACHECO

Villa de Señorío durante 31 años (1445-1476). Siglo XV.

San Clemente ya era CONCEJO MUNICIPAL en 1370 con los Villena, alcanzando un gran desarrollo territorial. El gran salto cualitativo lo alcanzó con el I Marqués de Villena, JUAN PACHECO en 1445 al obtener el III Señor de Belmonte San Clemente y su tierra, tras un intercambio con Juan II de Castilla al desear la villa de Ágreda que pertenecía e los Estados de Juan Pacheco.

Juan Fernández Pacheco, I Señor de Belmonte y Señor de la villa de Ágreda. Abuelo de Juan Pacheco.

De él surgieron las ramas de los Pacheco de Belmonte (de su hija María Pacheco) 

y de los Pacheco de San Clemente (de su hija Beatriz Pacheco) apareciendo los primeros escudos de armas en la villa sanclementina a finales del siglo VX.

Escudo de armas de los Pacheco.

Juan Pacheco en 1470 es nombrado MAESTRE DE LA ORDEN DE SANTIAGO de 1467 a 1474. Señor de San Clemente: gracias a las familias hidalgas se inicia la construcción del primer MONASTERIO a la advocación de Nuestra Señora de Santa María de Gracia, cuyas obras de la iglesia finalizaron en 1503, y cuyo convento fue ocupado por la Orden de San Francisco, ya presente en Belmonte en 1463.

La idea de la construcción de un primer Monasterio en San Clemente se fraguó en tiempos de Juan Pacheco y apoyado por los hidalgos de la villa encabezados por el Señor de Perona y de Villar de Cantos, Alonso del Castillo (modelo de fundadores múltiples), empezando las colectas con el fin de iniciar unas obras que finalizaron en 1503 con la inauguración de su iglesia:

Monasterio de Nuestra Señora de Santa María de Gracia.

Durante 7 años, las tierras de San Clemente estuvieron bajo el gobierno de la Orden de Santiago,  Provincia de Castilla: el Maestre fue a su vez Señor de su Concejo Municipal.

San Clemente perteneció a los Estados de los Pacheco, Señores de Belmonte hasta 1476. Tras la Concordia de la reina Isabel I de Castilla con el II Marqués de Villena, Diego López Pacheco Portocarrero, hijo del Maestre Juan Pacheco, en relación con la Guerra del Marquesado, pasó el Concejo sanclementino a la condición de tierras de realengo.

Los Pacheco de San Clemente terminaron como señores de muchos de los Señoríos que se conformaron alrededor de su jurisdicción: Minaya, Castillo de la Torre de Santiago, Villar de Cantos y Perona.

Las villas de Belmonte y de San Clemente quedaron históricamente "hermanadas" con Juan Pacheco y su linaje.

Villa de Realengo con ISABEL I DE CASTILLA 

Con la reina Isabel la Católica, San Clemente pasó a VILLA DE REALENGO en 1476 y la colmó de privilegios reales como el MERCADO FRANCO DE LOS JUEVES y Merced de no ser enajenada de la Real Corona de Castilla. Desde este momento, empezó a conformarse la "Corte Manchega de los Austrias" al contraer matrimonio la reina Juana I de Castilla, hija de Isabel I de Castilla, con Felipe el hermoso, perteneciente a la Casa de Austria, Habsburgos españoles, conformándose el San Clemente monumental que ha llegado a nuestros días como "Joya del Renacimiento" de Cuenca y de La Mancha Alta (siglos XVI y XVII).